Ordo Kapusin didirikan sekitar tahun 1525, ketika Sdr. Fransiskan Matteo da Bascio – yang ditahbiskan sebagai imam di wilayah Marche, Italia – yakin bahwa gaya hidup yang dijalani oleh Fransiskan pada masanya tidak sesuai dengan yang dibayangkan oleh Santo Fransiskus. Ia ingin kembali ke gaya hidup asli dalam kesendirian dan penebusan seperti yang dipraktikkan oleh pendiri ordo tersebut.
Atas gagasan baru ini, para atasannya mencoba untuk menekan, dan akibatnya, Matteo dan para sahabat pertamanya terpaksa bersembunyi dari otoritas Gereja, yang ingin menangkap mereka karena meninggalkan kewajiban keagamaan mereka. Ini adalah masa Reformasi Lutheran, dan oleh karena itu, segala upaya peremajaan sangat dianggap buruk oleh para atasan ordo keagamaan. Matteo dan teman-temannya menemukan perlindungan dengan biarawan Camaldolese; sebagai rasa terima kasih, mereka kemudian mengadopsi cawat yang dikenakan oleh ordo tersebut, yang merupakan tanda pertapa di wilayah Marche, selain dari mengenakan jenggot. Nama populer dari gerakan mereka berasal dari ciri ini pada pakaian mereka.
Pada tahun 1528, dengan perantaraan Caterina Cibò, Adipati Camerino, Matteo memperoleh persetujuan dari Paus Klemens VII dengan bull Religionis zelus. Ia diberi izin untuk hidup sebagai pertapa dan berkhotbah kepada orang miskin di mana pun. Izin ini tidak hanya untuknya, tetapi untuk semua yang ingin bergabung dengannya dalam upayanya untuk mengembalikan pengamalan yang paling harfiah mungkin terhadap aturan Santo Fransiskus. Matteo dan kelompok asli segera bergabung dengan yang lain, dan awalnya mereka disebut sebagai Friars Minor of the Hermetical Life, dan karena adanya oposisi dari pihak Observan, mereka menjadi kongregasi: Friars Minor Hermits, cabang dari Fransiskan Konvensional, tetapi dengan pimpinan mereka sendiri.
Masa sulit dialami pada tahun 1542, ketika Vikaris Jenderal Ordo, Bernardino Ochino, bergabung dengan Reformasi Protestan.
Paus Gregorius XIII, pada tahun 1574, mengizinkan Ordo ini untuk menetap di “Prancis dan semua bagian dunia lainnya serta mendirikan rumah, tempat, Custodies, dan Provinsi”, dengan memberikan izin untuk menyebarkan ajarannya di luar Italia. Pada abad ke-16, Kapusin memiliki sekitar 14.000 frater dengan hampir 1.000 biara. Jumlah anggota ordo ini akan terus meningkat antara tahun 1600 dan pertengahan abad ke-18. Akhirnya, mereka mencapai 34.000 frater dan 1.700 biara. Ini juga adalah tahun-tahun di mana Ordo ini memodifikasi, atau lebih tepatnya, menyempurnakan beberapa karakteristik awalnya. Sambil tetap setia pada sumpah kemiskinan radikal, Kapusin terbukti menjadi pengkhotbah yang sangat baik; dan ini, mengingat hubungan awal dengan cabang Konvensional, menyebabkan “konvensionalisasi”. Proses ini juga didukung oleh Takhta Suci, yang pada saat itu mendorong ordo keagamaan untuk menghapus rumah-rumah kecil atau kurang signifikan, yakin bahwa dengan mendorong fraternitas lokal yang lebih besar, mereka dapat lebih baik dikendalikan. Rak buku kecil awal menjadi perpustakaan sungguhan, yang diperlukan untuk memastikan pelatihan yang baik bagi pengkhotbah. Untuk memahami peran ordo ini selama satu setengah abad ini, pertimbangkan pilihan Alessandro Manzoni terhadap seorang Kapusin, Frater Cristoforo, untuk melawan Don Rodrigo dalam karyanya yang berjudul “Promessi Sposi” (The Betrothed).
Kapusin juga sangat aktif dalam misi-misi: sebagai contoh, seperti yang dilaporkan oleh Pellegrino da Forlì, keuskupan agung India di Agra diserahkan kepada saudara-saudara dari ordo ini sejak tahun 1703. Dari Paruh Kedua Abad Kedelapan Belas Hingga Saat Ini
Dari paruh kedua abad ke-18 hingga akhir abad ke-19, Ordo ini mengalami masa krisis. Ingatlah bahwa antara tahun 1787 dan 1847, tidak ada Kapitel Jenderal Ordo yang diadakan, hanya pertemuan para pimpinan utama di antara kelompok provinsi yang dibagi dalam Ordo tersebut. Kesulitan ini lebih disebabkan oleh alasan politik-sosial daripada alasan keagamaan. Revolusi Prancis dan pengalaman serupa di negara-negara Eropa lainnya menyebabkan penghapusan biara-biara dan bahkan provinsi-provinsi secara keseluruhan. Hal yang sama dapat dikatakan untuk Italia pada akhir abad kesembilan belas, di mana undang-undang Guarentigie melucuti ordo-ordo keagamaan dari banyak harta dan bahkan rumah-rumah keagamaan. Namun, ini disertai dengan pekerjaan misi yang lebih sadar, terutama di Amerika, di mana Ordo ini tumbuh dengan sangat pesat.
Meskipun mengalami kesulitan pada awal abad ke-20, Kapusin memiliki sekitar 9.500 anggota di lebih dari 600 biara. Kapitel Jenderal tahun 1884 telah memutuskan untuk membeli kembali banyak biara yang telah hilang selama abad sebelumnya dan Konstitusi baru disetujui. Pra precedens berasal dari tahun 1643. Abad ke-20 adalah, bagi semua ordo keagamaan, abad kembali ke akar dan keterbukaan terhadap inovasi di dunia kontemporer. Pertimbangkan Konsili Vatikan Kedua dan undangan kepada semua komunitas keagamaan untuk menemukan kembali alasan-asal mereka untuk kharisma mereka. Kapusin tidak terhindar dari krisis panggilan, yang melanda Gereja Katolik